| 序号 | 项目总编号 | 项目名称 | 推荐等级 | 推荐单位 | 完成单位 | 完成人员 |
| 1 | 902-2006-001 | 新型GaInAs(NSb)低维半导体光电子材料与器件 | 1 | 中国科学院半导体研究所 | 中国科学院半导体研究所 北京邮电大学 |
牛智川 韩勤 潘钟 孙宝权 郑厚植 任晓敏 吴荣汉 李国华 黄永清 杨富华 王晓东 倪海桥 李桂荣 杨晓红 章浩 |
| 2 | 904-2006-001 | 超分子构筑调控合成规整结构聚硅氧烷及其应用研究 | 1 | 中国科学院化学研究所 | 中国科学院化学研究所 | 张榕本 谢萍 戴道荣 |
| 3 | 905-2006-002 | 非周期光子晶体能隙及光传播特性研究 | 1 | 中国科学院物理研究所 | 中国科学院物理研究所 | 张道中 程丙英 金崇君 王义全 李兆霖 胡炜 李宏强 |
| 4 | 905-2006-003 | 低维强关联电子系统中的奇异自旋性质理论研究 | 1 | 中国科学院物理研究所 | 中国科学院物理研究所 浙江大学 |
王玉鹏 戴建辉 蒲富恪 |
| 5 | 910-2006-001 | 微扰QCD方法研究B介子非轻子衰变 | 1 | 中国科学院高能物理研究所 | 中国科学院高能物理研究所 | 吕才典 杨茂志 李营 |
| 6 | 914-2006-001 | 环渤海地区土地利用变化与土地持续利用 | 1 | 中国科学院生态环境研究中心 | 中国科学院生态环境研究中心 北京大学 中国科学院地理科学与资源研究所 |
傅伯杰 陈利顶 蔡运龙 李秀彬 马克明 何书金 王仰麟 刘国华 朱会义 郭旭东 张明 |
| 7 | 917-2006-001 | 空间分析模型 ──理论、方法与应用示范研究 | 1 | 中国科学院地理科学与资源研究所 | 中国科学院 地理科学与资源研究所 | 王劲峰 李连发 葛咏 柏延臣 孟斌 武继磊 孙英君 刘旭华 韩卫国 王智勇 王海起 李新虎 |
| 8 | 932-2006-005 | 光弹性贴片技术及工程应用研究 | 2 | 机械科学研究院 | 北京机电研究所 | 严承蔼 戴积林 范广宏 |
| 9 | 979-2006-002 | 解析数论中的若干重要问题 | 1 | 中国科学院数学与系统科学研究院 | 中国科学院数学与系统科学研究院 | 贾朝华 |
| 10 | I01-2006-004 | 低维功能纳米材料的合成、结构与性能研究 | 1 | 清华大学 | 清华大学 | 李亚栋 王训 彭卿 孙晓明 李晓林 王军伟 葛建平 刘军枫 |
| 11 | I02-2006-002 | 原子水平上担载催化剂几何结构的基础研究 | 1 | 北京大学 | 北京大学 | 寇元 王弘立 林励吾 邹鸣 赵东滨 闵恩泽 |
| 12 | I02-2006-003 | 反应扩散体系中斑图形成的若干实验研究 | 1 | 北京大学 | 北京大学 | 欧阳颀 王宏利 周路群 |
| 13 | I03-2006-001 | 近地表风沙活动规律研究 | 1 | 北京师范大学 | 北京师范大学 | 史培军 邹学勇 刘连友 哈 斯 严 平 张春来 李小雁 程宏 高尚玉 邱国玉 王贵勇 强明瑞 刘小平 陈玲 |
| 14 | I04-2006-001 | 光学分数傅立叶变换及其在光学信息处理中的应用 | 1 | 首都师范大学 | 首都师范大学 哈尔滨工业大学 中国科学院物理研究所 |
张 岩 刘树田 顾本源 朱邦和 董碧珍 |
| 15 | I07-2006-001 | 实时多媒体系统形式模型和设计方法 | 2 | 北京邮电大学 | 北京邮电大学 | 马华东 |
| 16 | I12-2006-001 | 插层结构及其组装的基础研究 | 1 | 北京化工大学 | 北京化工大学 | 段雪 何静 李峰 卫敏 戴伟 李殿卿 杨文胜 张慧 杨兰 张法智 蒲敏 鄢红 |
| 17 | I13-2006-001 | 基于神经网络的容错控制系统故障诊断与可靠性研究 | 1 | 北京航空航天大学 | 北京航空航天大学 | 王少萍 焦宗夏 崔明山 呼文亮 尚耀星 石健 苑中魁 陶建峰 杨光琴 刘红梅 梁磊 岳荣刚 |
| 18 | I16-2006-002 | 流媒体高效存储与版权保护的研究 | 2 | 北京交通大学 | 北京交通大学 | 赵耀 裘正定 倪蓉蓉 朱振峰 白慧慧 翁韶伟 |
| 19 | I51-2006-001 | TiO2-蒙脱石纳米复合材料及其光催化性研究 | 3 | 中国地质大学（北京） | 中国地质大学（北京） | 廖立兵 王丽娟 |
| 20 | I53-2006-004 | 功能晶体材料的结构和应用基础理论研究 | 2 | 中国石油大学（北京） | 中国石油大学（北京） | 卢贵武 邵长金 张鹏 孙为 王爱军 |
| 21 | J01-2006-008 | 中国琥珀昆虫研究 | 1 | 北京科学技术研究院 | 北京自然博物馆 | 洪友崇 王文利 |
| 22 | J02-2006-006 | 重要经济植物扁桃种质资源评价与利用技术 | 2 | 北京市农林科学院 | 北京农业生物技术研究中心 西北农林科技大学 |
马荣才 谢华 徐勇 常凤启 郭春会 曹鸣庆 梅立新 张檀 |